分公司给总公司往来款要算利息吗?

一般情况下计算往来利息，前提是你们有过合同约定过利率，相当于是母公司与分公司的借款。正常情况下没有合同约定不需要计算利息，没有时间限制。

总公司打给分公司的往来账款分公司需交税吗?

往来账款暂时不需要交税，如果总公司与分公司各自是独立的法人单位，有被税务部门核定利息的风险，如核定要计利息收入，就应该交营业税5%及相应的流转附加税，另外应纳税所得额被调增。

往来款是否要计提关联方利息?

不需要计提利息。但是一般企业内部管理的时候会根据内部的往来款计算EVA。